Det er synkende oksygenkonsentrasjoner i dypere vannmasser i Bunnefjorden og Vestfjorden mens det det fortsatt er gode oksygenforhold i dypvannet i Bekkelagsbassenget. Alle høyere former for marine organismer har minstekrav til vannets oksygenkonsentrasjoner, reker krever > 1 ml/l og torsken har større krav. I Vestfjorden var det dypvannsfornyelse mellom mai og august. Det er fortsatt mulighet for dypvannsfornyelse i Indre Oslofjord utover vinteren. Temperaturen i Vestfjorden er blant de høyeste som er målt i perioden 1933 – 2010. Siktedypet har blitt betydelig bedre i fjorden siden 1970-tallet som følge av rensetekniske tiltak. Plante og dyrelivet i gruntvanns-samfunnene har blitt rikere, og større del av fjordens grunnområder er nå produktive.
