Undersøkelser av naturtilstand, ved hjelp av foraminiferundersøkelser bakover i tid, viser generelt gode oksygenforhold i fjordsystemet frem til slutten av 1800-tallet.Men menneskelig påvirkning har ført til redusert oksygen i bunnvannet, sannsynligvis som følge av økt tilførsel av næringssalter og nedbrytning av organisk materiale.Selv om forurensningsbelastningen har avtatt de site tiårene, er det fremdeles mye «oksygengjeld» i sedimentene som fører til en tidsforsinkelse med hensyn til restituering av bunnfaunaen. Oksygenforholdene er stort sett «gode» i bunnvannet i Vestfjorden sør for Steilene. «Svært dårlige» oksygenforhold i Bunnefjorden. Ingen bunnvannutskiftning i Bunnefjorden. Bunnvannutskiftning fant sted i Vestfjorden i løpet av vinteren. Siktedypet i april 2016 er dårligere enn på samme tid i 2015.
